我國是化學原料藥生產大國，尤其是藥物產品的產能產量位居世界前列；而原料藥生產過程中產生的“三廢”量大，廢物成分復雜，污染危害嚴重，尤其是制藥廢水。 

醫藥廢水的特征：COD含量高；

                有機物含量高；

                生化性差；

                含有有毒有害物質；

                處理難度大。

醫藥廢水的水質特點使得多數醫藥廢水單獨采用生化法處理根本無法達標，所以在生化處理前必須進行預處理。一般應設置調節池，調節水質水量和PH值，且根據實際情況采用某種物化或化學法作為預處理工序，一以降低水中的SS、鹽度及部分COD，減少廢水中的生物抑制性物質，并提高廢水的可降解性，以利于廢水的后續生化處理。

預處理后的廢水，可根據其水質特征選取某種厭氧和好氧工藝進行處理，若出水要求較高，好氧處理工藝后還需繼續進行后處理。

醫藥廢水處理總的工藝路線為預處理—厭氧—好氧—后處理組合工藝。常見的有：水解酸化—接觸氧化—過濾的組合工藝、氣浮—水解—接觸氧化組合工藝、復合微氧水解—復合好氧—砂濾組合工藝、氣浮—UBF—CASS組合工藝、絮凝沉淀—Fenton—UASB—接觸氧化—MBR組合工藝等。

具體的工藝以廢水的水質和廢水中污染物的種類為依據進行選擇。